冷冻干燥机技术在真空状态下，将冷冻样品中的水份等溶剂通过升华的方式移出样品，最终使样品干燥。整个冻干过程中样品空间结构没有改变，极易重新溶解，保证了样品的生物，化学结构和活性。
冷冻干燥机配套空压机使用时不要放在日晒、雨淋、风吹或相对湿度大于85%的场所。不要放置在灰尘多、有腐蚀性或可燃性气体的环境中。不要放置在有振动、冷凝水有冻结危险的地方。不要离壁面太近，以免通风不良。不得已需在有腐蚀性气体的环境中使用，应选用铜管经防锈处理或不锈钢热交换器型，在40℃温度以下的环境使用。
空压机产出的压缩空气与冷冻干燥机的进口不要接错。为便于维修，要确保维修空间，应设置旁通管路。要防止空压机的振动传给冷冻干燥机。配管重量不要直接加在干燥机上。
冷冻干燥机配套空压机使用时排水管不要向上立着，不要打折或压扁。冻干机电源电压允许波动小于±10%。应设置适当容量的漏电断路保护器。使用前必须接地。压缩空气进口温度过高、环境温度过高(40℃以上)、使用流量超过额定处理空气量、电压波动超过±10%、通风太差(冬季也要换气，否则室温也会升高)等情况下，保护电路会发挥作用，指示灯灭，停止运转。
当空气压力高于0.15MPa时，常开式自动排水器的排水口才能关闭。空压机的排水最太小时，排水口处于开启状态，有空气吹出。如果空压机产出的压缩空气质量差，如混入灰尘和油分，这些赃物会粘附在热交换器上，降低其工作效率，同时排水也易失效。希望在冷冻干燥机进口设置过滤器，并要确认一天排水不少于一次。冻干机的通风口每月要用吸尘器清扫一次。
此外要注意接通电源时，待运转状态稳定后，再接通压缩空气。停止运转后，必须等待3min以上才能再起动。
