1、材质要求设备、管道所选材料应根据装载、贮存或输送物料的理化性质和使用工况等因素来确定，使之满足工艺要求，不吸附、不污染介质，且施工、维修方便。对于直接接触药物的设备、管道要求较高。规范规定：凡与药物直接接触的设备内表面应采用不与药物反应、不释放出微粒及不吸附药物的材料；凡与药物直接接触的容器、工器具不得使用竹、木、藤等材质制造；为了避免纯水、注射用水在贮存和输送中被二次污染，其管材应采用低碳优质不锈钢管或其他不污染水质的材料（如硬聚氯乙烯管、聚丙烯管或工程塑料管），阀门与管件应采用相应的材料制作。有资料表明，聚氯乙烯对水的污染是不锈钢的7.6倍，而常用的18 -8和321不锈钢由于含碳量高，同样不适宜用来制作设备和工艺管道。从洁净和灭菌要求考虑，贮存、输送纯水、注射用水、无菌介质和成品的设备、管道宜采用含碳量分别是0. 08%、0.0390的316钢和316L钢，以减少材质对药品和工艺水质的污染。
2、从竖管上引出的支管应尽可能短，一般不宜超过支管直径的6倍，以防水在横管上静止滞留。
3、对不允许断水的车间，给水引入管应设置两条，在室内连成环状或贯通枝状双向供水，引入管宜分设于室外环网的不同侧。
4、排水系统应根据排出废水的性质、浓度及水量等进行设计，并应根据不同情况采取废水处理和综合利用措施，且排水主管不应穿过洁净度要求高的房间。
5、100级的洁净室内不宜设置地漏，10000级和100000级的无尘车间也应少设地漏。其地漏所用材质应不易腐蚀，内表面光洁，不易结垢，在构造上应设密封盖，且开启方便，能防止废水废气倒灌，必要时还应能根据产品工艺要求消毒灭菌。
6、洁净室内与回水管道相连的设备、卫生器具和排水设备的排出口以下部位必须设水封装置。
7、洁净厂房内应采用不易积存污物、易于清扫的卫生器具、管材、管架及其附件。同样，阀门选用也以不积液的为好，不宜使用普通截止阀、闸阀，宜使用清洗、消毒方便的旋塞阀、球阀、隔膜阀、卫生蝶阀、卫生截止阀等。