卫生院医疗机构污水特点还体现在综合污水BOD5/CODcr高，可生化性较强，溶解性CODcr占有很大比例，适合于生物法进行处理。污水的原水水质不同于生活污水，其成分更非常复杂，含有多种药物比如：消毒剂，来自化验、检验、手术各科室的重金属、有机试剂等；还含有多种病菌寄生虫卵等有害细菌。它们在环境中具有一定的适应力，有的甚至在污水中存活时间较长，若未经处理即排入水体或用于灌溉，将会严重污染环境，影响人民身体健康。所有卫生院废水必须经过严格的处理后才能排出。
卫生院污水废水处理工艺流程：
废水主要污染物是各种病菌和少量有机物。化粪池出来的废水经过格栅处理大的悬浮固体后流入调节池，在调节池内调节水量和水质，调节池设有液位，污水提升系统；设备同时还进行厌氧水解，将部分大分子有机物降解微小分子有机酸；经水解后的水流进生物接触氧化池进行生物处理，经生物处理后出水进入沉淀池，沉淀池的水进入接触消毒池，同时消毒剂与水泵联动进行同步投加，*后出水达标排放。采用“调节池—生化处理—沉淀池--二氧化氯消毒”作为主体处理工艺。该方法具有耐冲击负荷能力强，处理效果稳定可靠、管理简单、污泥产量少等特点。
此工艺效果好，出水达到医疗机构污水排放标准，全自动控制，操作简单方便。
