抗微生物化学试剂可分为三类：杀菌剂，消毒剂和杀孢子剂。

1、杀菌剂

由于蒸发快、残留低的特点，消毒已被带入APA的物品时应使用醇类（即异丙醇和乙醇）化学试剂。除非与材料存在相容性问题，应使用70％异丙醇（IPA）代替70％乙醇（ EtOH），因为异丙醇的杀菌作用被认为比乙醇稍大。虽然醇类对活细胞具有相对较好的杀菌活性，但醇类的快速挥发显著降低了其效力。醇类杀菌剂对孢子无效。

2、消毒剂

酚类和季铵化合物对活细胞具有广谱杀菌活性。这些化学物质典型特征会带来表面残留。紧随它们的使用应清除该部分残留，例如通过异丙醇擦拭清除。

3、杀孢子剂

次氯酸钠（漂白剂）和过氧化氢/过氧乙酸化合物是广泛使用的杀孢子剂。过氧化氢也可用于（通常在6％浓度）提供对霉菌和一些孢子形式微生物提供抗菌活性。过氧化物比醇类抗菌活性更高，分解后形成水和氧气，不产生留残。当消毒程序要求清除孢子类微生物时应采用化学杀孢子剂。不幸的是，除过氧化氢外这些化学品均有一定残留。

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