测土配方施肥技术源于测土，测土配方施肥是测土配方施肥的基础。纵观我国推广测土配方施肥的发展历程，成效显著，但也存在一些不容忽视的问题。主要原因是这项技术没有得到广泛深入的应用。测土配方施肥仪在我国测土配方施肥措施的实施中发挥着重要作用，也是目前我国精准农业的重要组成部分。
据调查，到目前为止，能够真正做到测土配方施肥的农民比例很小，大部分地区还停留在试验示范的水平，技术覆盖面还比较小，农民的施肥观念和接受度还存在很多问题，传统的施肥模式和盲目施肥现象仍然普遍存在。造成这种情况的原因有很多。测土配方施肥技术推广力度较弱。目前，我国测土配方施肥项目虽然已实现全国农业县全覆盖，但其技术入户到位率较低。根本原因是我国农业技术推广体系不完善，农业技术推广服务不到位。由于历史原因，目前大多数县的农业技术推广体系仍处于瘫痪或半瘫痪状态，从业人员存在知识老化、年龄老化、新梯队困难等严重问题。测试方法需要进一步改进。
重无机轻有机的传统施肥模式依然盛行。以及计量、分配和供应环节的不协调。配方施肥技术是一项系统工程，需要各个环节的配合和协调。然而，由于测量、分配和供应之间的脱节，通常只测量不匹配和分配，而不测量供应。监督机制不完善。化肥行业虽然实行准入机制多年，但由于缺乏有效监管，打着测土配方施肥的幌子欺骗农民的现象时有发生。
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