X射线单晶衍射仪通过X射线与晶体中规则排列原子的相互作用，结合精密仪器与数学计算，揭示分子三维结构，其原理与流程如下：
核心原理：X射线衍射与布拉格方程
当单色X射线（如铜靶的CuKα辐射）照射到单晶体上时，晶体中规则排列的原子间距与X射线波长数量级相当，原子散射的X射线发生干涉，在特定方向（满足布拉格方程nλ=2dsinθ的方向）产生强衍射。其中，λ为X射线波长，d为晶面间距，θ为入射角，n为衍射级数。衍射方向与晶体结构直接相关，每种晶体产生独特的衍射花样。
关键步骤：从衍射数据到三维结构
数据采集：
仪器通过高精度测角仪（如四圆衍射仪）控制晶体旋转，使不同晶面依次满足衍射条件。探测器（如光子计数型CCD）捕获衍射信号，记录衍射点的位置和强度，形成包含晶体结构信息的二维衍射图。
数学反演：
衍射点强度与原子在晶胞中的分布相关。通过傅里叶变换，将衍射数据转换为晶胞内电子密度的三维分布图。原子位置对应电子密度峰值，从而确定原子坐标、键长、键角等参数。
结构验证与优化：
结合化学键信息（如键长范围）和对称性分析，修正初始结构模型，最终确定分子的精确三维构型。
技术优势与应用场景
原子级分辨率：可精确测定原子位置，揭示分子立体构型、手性及晶体堆积方式。
广泛适用性：从简单无机物到复杂生物大分子（如蛋白质-配体复合物），均可通过该技术解析结构。
关键应用：在药物开发中，该技术可确定药物晶型、优化分子设计；在材料科学中，助力设计具有特定性能的金属有机框架（MOF）或共价有机框架（COF）材料。
