进行样品前处理，搅拌机能有效的在**步骤减少样品尺寸，但从本图可看出搅拌机用于心脏组织，许多微纤维仍保持完整。
超声破碎法是一种利用空穴效应(cavitation)进行样品处理的过程。在Sonication中，利用探头振福(Amplitude)快速扩张与收缩所产生的空穴效应(cavitation)来进行样品处理。
一般来说对细胞悬浮液、微生物、动植物组织来说，超声破碎法应是*有效的均质法。由于气穴现象产生的巨大能量可在数秒内破坏大部分的细胞样品。是进行此类样品处理的*佳选择。
但是，这个方法也有很大的限制。当样品内含有小微粒时，超声破碎法是很有利的方法，例如细胞或预先均质过的组织。对较大块的固体组织来说（一般1mm以上），超声破碎法则是无效的方法。另外，超声波破碎法也会产生巨大的热能，会使蛋白质变性。这可利用短暂的冰浴来解决。
超声破碎法的产能也是个问题。若不需要考虑交叉污染的问题，则可以一次对多种样品使用单一探针。有多种探头可供选用，但样本与样本之间效果存在差异，需要谨慎的进行调研论证。北京星越生物科技有限公司作为BRANSON Sonifier 超声破碎仪的长期代理，积累了丰富的使用案例和实验方案，非常愿意为使用者提供相应的经验。对于新型应用，我们也很希望可以共同探讨，努力提供*好的解决方案。
